Не, mysqli_query няма автоматично да промени нивото на изолация. Свързването чрез mysqli е в много отношения точно като свързването чрез mysql cli. И в двата случая ще получите нивото на изолация по подразбиране. И точно като cli, mysqli не може да прави никакви предположения за това какви изявления ще идват през връзката.
Както и да е, ако имате основателни причини да се притеснявате за нивото на изолация, мисля, че трябва просто да го зададете изрично, напр.:
$mysqli_connection->query("SET TRANSACTION ISOLATION LEVEL READ UNCOMMITTED");
По този начин можете да гарантирате, че имате нивото на изолация, което искате, и можете да коментирате причините си в кода.
