MYSQL заявката се изпълнява много бавно

Индексите са ваш приятел.

UPDATE User ... WHERE id = ... -- Отчаяно се нуждае от индекс на ID, вероятно PRIMARY KEY .

По същия начин за renameSource .

SELECT * 
FROM `User` `t` 
WHERE `t`.`firstName`='Franck' 
  AND `t`.`lastName`='ALLEGAERT ' 
  AND `t`.`dateOfBirth`='1971-07-29' 
  AND (userType NOT IN ("1")) 
LIMIT 1;

Необходими са INDEX(firstName, lastName, dateOfBirth); полетата могат да бъдат в произволен ред (в този случай).

Погледнете всяка заявка, за да видите от какво се нуждае, след което добавете този INDEX до масата. Прочетете моята готварска книга за изграждане на индекси .