Като гледам вашата sql заявка, изглежда, че искате да сортирате по брой. Така че в mongo заявката също трябва да споменете countA
като поле за сортиране.
db.coll.aggregate([
{
$group: {
_id: "$mainsubject.code",
countA: { $sum: 1}
}
},
{
$sort:{'countA':1}
}
])