Не видях отговор и имах същия въпрос днес.
Можете да премахнете базата данни преди с:
use <db>
db.dropDatabase()
Или можете да премахнете колекцията само с:
db.<collection>.drop()
Проблемът с вашата команда може да е, че нещо липсва, като базата данни, срещу която се удостоверявате, или потребителят, или може би друго нещо.
В моята настройка това работи
mongorestore --username=<user> --db=<database> --authenticationDatabase=<database> --dir=<dumpdir> --drop
Ако вашият дъмп е бил компресиран предварително, можете да добавите флага --gzip в края.
Можете да намерите всичко това в документацията за премахване на база данни или в документацията за премахване на цяла база данни. Но моля, бъдете внимателни с него.
