Прегледайте всички колекции на Mongo и изпълнете заявка

Има db.getCollectionNames() помощен метод, който прави това вместо вас. След това можете да внедрите своя код:

db.getCollectionNames().forEach(function(collname) {
    // find the last item in a collection
    var last_element = db[collname].find().sort({_id:-1}).limit(1);
    // check that it's not empty
    if (last_element.hasNext()) {
        // print its timestamp
        printjson(last_element.next()._id.getTimestamp());
    }
})

Вероятно искате и .hasNext() проверете там, за да се погрижите за възможни празни колекции.