Опитайте да използвате Помощна програма SQLCMD :
Пример:
sqlcmd -E -S server_name -d database_name -Q "EXEC schema.storedprocedure parameter01, parameter02"
Ако искате да проучите други опции, бих искал да споделя тази връзка:
Помощни програми за команден ред:Приложимо за SQL Server 2005