Може да се направи с една команда. Трябва да зададете свойството IDENTITY за "автоматичен номер":
ALTER TABLE MyTable ADD mytableID int NOT NULL IDENTITY (1,1) PRIMARY KEY
По-точно, за да зададете ограничение на ниво таблица с име:
ALTER TABLE MyTable
ADD MytableID int NOT NULL IDENTITY (1,1),
CONSTRAINT PK_MyTable PRIMARY KEY CLUSTERED (MyTableID)
Вижте ALTER TABLE и IDENTITY в MSDN