$load_query = "LOAD DATA LOCAL INFILE '{$file}' INTO TABLE `{$table}`
FIELDS TERMINATED BY ',' ENCLOSED BY '\"' (col1, col2, ... , @col_with_spaces)
SET col_with_spaces = RTRIM(@col_with_spaces);";
По този начин няма да е необходимо да обработвате предварително файла, нито да създавате други актуализации в таблицата.