Просто ляво съединение?
SELECT organisation.*
FROM organisation
LEFT JOIN srp_reseller_buffer ON
(organisation.organisation_id = srp_reseller_buffer.organisation.id AND property_id = 'X')
WHERE srp_reseller_buffer.organisation_id IS NULL
Записите, които не съществуват от „дясната“ страна (srp_reseller), ще бъдат нулеви.