Проблемът беше с MySQL 5.5, който изпълнява подзаявки неефективно. Моят домашен компютър работи с MySQL 5.6, който е много по-добър в това отношение. Затова надстроих MySQL на EC2 до версия 5.6 и стана почти толкова бърз, колкото домашния ми компютър (доколкото само един се отнася за едновременна заявка).
