Когато стартирате от командния ред след компилиране на вашия клас, използвайте това
java -classpath .;mysql-connector-java-5.0.8-bin.jar Version
Съхранявайте както jar, така и java файла в една и съща директория и опитайте. използвайте ";" вместо ":", както е споменато по-горе. включете името на пакета, ако има такова. Тествах работата му.