Hibernate ManyToMany изберете

Възможно е да разрешите този проблем, като картографирате асоциацията си два пъти по следния начин с @Where анотация.

@ManyToMany(mappedBy = "agents") 
@Where(clause = "status = 'ACTIVE'")
private List activeMissions

@ManyToMany(mappedBy = "agents")
private List missions

Пълно обяснение можете да намерите тук https://thoughts- on-java.org/hibernate-tips-filter-entities-mapped-association/