Flask, не всички аргументи са преобразувани по време на форматиране на низ

Просто превърнах предишния си коментар в отговор, тъй като изглеждаше правилното решение :-)

Проблемът идва от друга линия. Имате това:

        x = c.execute("SELECT * FROM users WHERE email = (%s)",
                      (email))

Това не прави това, което може би си мислите, че прави. Поставяне на email в скоби не прави нищо, така че редът всъщност е еквивалентен на предаване на всеки знак от каквото и да е в тази променлива в списък със знаци. Ако вместо това направите това:

        x = c.execute("SELECT * FROM users WHERE email = (%s)",
                      (email,))

...тогава ще предавате кортеж, съдържащ един елемент, email , и би трябвало да работи по-добре.