Въпреки че mysqldump е често съобщаваната причина за това, тя не е единствената.
В моя случай изпълняването на artisan:migrate във всяка база данни също ще задейства тази грешка за различни бази данни на същия сървър.
http://bugs.mysql.com/bug.php?id=42041 Споменава заключване/флуш на таблица, които биха били извикани в mysqldump, така че си струва да проверите дали имате някакви миграции, заключвания или изтривания, които се случват едновременно.
Ако не успеете, опитайте да превключите подготовката към емулирана.
'options' => [
\PDO::ATTR_EMULATE_PREPARES => true
]