Тъй като гледате на доста равномерен микс от трафик за четене/запис, InnoDB е по-добрият избор. Заключването на цялата маса на MyISAM при всяко записване вероятно ще бъде убийство. MyISAM се представя по-добре с 90%+ ситуации за четене или 90%+ за писане.
Смятам, че това е споменато в Високопроизводителен MySQL