Няма начин да се организират йерархично таблици, което да има смисъл за MySQL.
Както други отбелязаха, можете да поддържате отделни схеми (в MySQL, бази данни) или можете да разработите и използвате структура за именуване на таблици, която организира вашите таблици по начин, който е смислен за потребителите (но все още не е от значение за MySQL).