По-добър начин за генериране на този json масив от MySql данни с php

Като премахнете всички излишъци, като използвате правилно подготвени оператори (приемайки PDO) и добавите обработка на грешки (поне мъниче), в крайна сметка ще получите това:

$stmt = $conn->prepare('SELECT name, age, address, pincode FROM json WHERE name = ?');
$stmt->execute(array('peter'));

if ($row = $stmt->fetch(PDO::FETCH_ASSOC)) {
    echo json_encode($row);
} else {
    echo json_encode(array('status' => 'error'));
}

Ако очаквате няколко реда:

echo json_encode($stmt->fetchAll(PDO::FETCH_ASSOC));