Не би трябвало да има никаква вреда при свързването на вашето приложение rails към съществуваща база данни. Ще трябва да следите за всичко, което противоречи на конвенциите за релсите (например имената на таблици са множествено число на модели) и или да промените базата данни (и вашето php приложение), или да програмирате проблема в релсите.
Но първата стъпка е просто да се свържете с базата данни и да направите модели за съществуващите таблици и да видите какво работи и какво не.
След това публикувайте тук с конкретни проблеми.
Като предложение, направете резервно копие на вашата база данни и започнете да програмирате срещу нея, за да изградите приложението си и се уверете, че всичко работи безопасно.