Ето един добър анализ на тези два подхода:SQL ляво присъединяване срещу множество таблици на ред FROM?
Това обяснение е общо, не съм много сигурен какво прави MySQL по този въпрос; но така или иначе въпросът е, че JOIN винаги е по-ясен и ясен и може да бъде преместен от една машина в друга без големи промени в логиката на заявката.