Само просто решение, грозно, не елегантно, но работи в този случай:
$original_reserved = $this->db->_reserved_identifiers;
$this->db->_reserved_identifiers[] = 5;
$this->db->_reserved_identifiers[] = 1;
// or any other values
$this->db->join('with critical values and conditions');
// some db-stuff
$this->db->_reserved_identifiers = $original_reserved;
Ако някой знае по-добре, моля да го покаже!