Най-лесният начин, по който направих това, беше да добавя ";--" в края на sql кода:
String sql = "INSERT INTO testTable(var1, var2) values ("1","2"), ("1","2") RETURNING id;--";
PreparedStatement ps = getConnection().prepareStatement(sql, Statement.RETURN_GENERATED_KEYS);
ps.executeUpdate();
ResultSet rs = ps.getGeneratedKeys();