Използвайте
db.system.js.save( { _id : "myDatabaseAverage" , value : function(){
// ..do something
} } );
Това ще съхрани JS функцията на сървъра и ще може да бъде достъпна от m/r от този момент нататък.
За допълнителни примери вижте:mongo/jstests/core/mr_stored. js