Също така се сблъсках с подобен проблем с някои изтеглени кодове - shell работи правилно, но драйверът на Node се провали (нямаше друга външна библиотека като mongoose). Моята инсталирана версия на MongoDB беше 2.6.6 и package.json имаше запис в mongodb като "~1.3.18". По предложение от някого промених въведената стойност на "~1.4.31", което разреши проблема ми.