Spring Data MongoDB елиминира POJO

Не мисля, че можете да го направите без pojo, когато използвате spring-data. Най-малкото, което можете да направите, е това

public interface NoPojoRepository extends MongoRepository<DummyPojo, String> {
}

и създайте фиктивно pojo само с id и карта.

@Data
public class DummyPojo {
  @Id
  private String id;
  private Map<String, Object> value;
}

Тъй като това поле за стойност е карта, можете да съхранявате почти всичко.