Можете ли да търсите други модели с методи на екземпляри в Mongoose?

Проблемът е циркулярно импортиране (fish.js изисква user.js който изисква fish.js и т.н.).

Можете да заобиколите това, като разрешите класа на модела по време на изпълнение:

UserSchema.methods.fishes = function(callback) {
  mongoose.model('Fish').find({user: this._id}, function(err, fishes) {
    callback(err, fishes);
  });
};