Трябва да използвате $elemMatch . С Mongoid, следният ред трябва да свърши работа
TopDoc.elem_match(inside: { first_name: 'Bob', last_name: 'Jones' })
което е еквивалентно на :
TopDoc.where(:inside.elem_match => { first_name: 'Bob', last_name: 'Jones'})