В допълнение към отговора на gregor, използването на Guids в момента ще предотврати използването на новата Aggregation Framework, тъй като тя е представена като двоичен тип. Независимо от това, можете да правите това, което искате, по по-лесен начин. Това ще позволи на библиотеката mongodb bson да се справи с преобразуването вместо вас.
public class MyClass
{
[BsonRepresentation(BsonType.String)]
public Guid Id { get; set;}
}