В MongoDB как мога да огранича заявката, когато моето обратно извикване е вътре в find?

Разбрахте почти правилно. Опитайте това:

db.privateMessages.find( { $or : [ {fromId: userId, toId: socket.userId} , 
                                   {fromId: socket.userId, toId: userId} ] },
                         {}, 
                         { limit : 2 }, 
                         function(err, messages) { pushSvdMsgs(messages); });

Синтаксисът е find(query, fields, options) . Имаме нужда от този празен обект, за да накараме драйвера да интерпретира правилно опциите.