От документите.
Можете да подадете batchSize с AggregationOptions във версия Spring Mongo 2.x
Aggregation aggregation = newAggregation(unwind, group).withOptions(newAggregationOptions().cursorBatchSize(100).build());
С размер на партидата по подразбиране
Aggregation aggregation = newAggregation(unwind, group).withOptions(newAggregationOptions().cursor(new Document()).build());