Да, проблемът беше в старите файлове:
ib_logfile0, ib_logfile1, ibdata1.
Трябва също да ги архивирате, да затворите WAMP, да копирате, поставите и премахнете генерираните от инсталацията. След това phpMyAdmin разпознава таблиците, които имахме преди преинсталирането на WAMP!