Уверете се, че сте изчистили привилегиите:
GRANT ALL PRIVILEGES ON *.* TO 'root'@'%' WITH GRANT OPTION;
FLUSH PRIVILEGES;
От документацията :
ПРИВИЛЕГИИ НА ПРОМИВАНЕ
Презарежда привилегиите от таблиците за предоставяне в базата данни на mysql.
Сървърът кешира информация в паметта в резултат на оператори GRANT и CREATE USER. Тази памет не се освобождава от съответните оператори REVOKE и DROP USER, така че за сървър, който изпълнява много екземпляри на операторите, които причиняват кеширане, ще има увеличение на използването на паметта. Тази кеширана памет може да бъде освободена с FLUSH PRIVILEGES.
