Entity Framework и SQL Server ще заключат ли обект/запис, докато го изтриват

Едното или другото ще се изпълни първо.

Ако вашата съхранена процедура се изпълни втора, ще получите изключение поради израза if в съхранената процедура.

Ако командата EF се изпълни втора, ще има OptimisticConcurrencyException, вижте:EF еквивалент за редове, засегнати от SqlCommand.ExecuteNonQuery