Късен отговор, но може да бъде полезен за посетителите на нишката
Освен другите споменати решения, мога да предложа да опитате ApexSQL Data Diff. Той може да сравнява и синхронизира данни от бази данни на SQL Server (в живи бази данни, както и резервни копия), както и да автоматизира и планира миграции на данни. Работи и с огромни бази данни и може да извършва сравнения директно от SSMS.
Можете да изтеглите този инструмент безплатно и да играете с него. Той разполага с напълно функционална безплатна пробна версия и предлага общностно издание (след изтичане на пробния период), което работи на SQL Express и Azure SQL Database.
За да научите повече за инструмента, можете да посетите http://www.apexsql.com/sql_tools_datadiff.aspx