Можете да деактивирате и активирате индексите. Имайте предвид, че деактивирането им може да доведе до нежелани странични ефекти (като дублиране на първични ключове или уникални индекси и т.н.), които ще бъдат открити само при повторно активиране на индексите.
--Disable Index
ALTER INDEX [IXYourIndex] ON YourTable DISABLE
GO
--Enable Index
ALTER INDEX [IXYourIndex] ON YourTable REBUILD
GO