Двигателите и връзките имат execute() метод, който можете да използвате за произволни sql изрази, както и Sessions. Например:
results = sess.execute('myproc ?, ?', [param1, param2])
Можете да използвате outparam() за да създадете изходни параметри, ако трябва (или за параметрите за свързване използвайте bindparam() с isoutparam=True опция)