Искате whereIn
с масив от вашите идентификатори за проверка...
$news = News::whereHas('newsCategories', function($q) use($array_of_ids)
{
$q->whereIn('category_id', $array_of_ids)
->orderBy('created_at', 'desc');
})->get();
Просто се уверете, че предавате нещо, което наистина е масив :)