Как селективно да изхвърлите всички innodb таблици в mysql база данни?

Ако това беше еднократна операция, бих направил:

use DB;
show table status name where engine='innodb';

и направете правоъгълно копиране/поставяне от колоната Име:

+-----------+--------+---------+------------+-
| Name      | Engine | Version | Row_format |
+-----------+--------+---------+------------+-
| countries | InnoDB |      10 | Compact    |
| foo3      | InnoDB |      10 | Compact    |
| foo5      | InnoDB |      10 | Compact    |
| lol       | InnoDB |      10 | Compact    |
| people    | InnoDB |      10 | Compact    |
+-----------+--------+---------+------------+-

в текстов редактор и го преобразувайте в команда

mysqldump -u USER DB countries foo3 foo5 lol people > DUMP.sql

и след това импортирайте след замяна на всички екземпляри на ENGINE=InnoDB с ENGINE=MyISAM в DUMP.sql

Ако искате да избегнете магията на правоъгълното копиране/поставяне, можете да направите нещо като:

use information_schema;
select group_concat(table_name separator ' ') from tables 
    where table_schema='DB' and engine='innodb';

което ще върне countries foo3 foo5 lol people