Опитайте се да намалите значително размера на кеша на заявките. 1G вероятно е твърде голям.
Започнете с 16M или 32M и коригирайте съответно query_cache_limit (256K?) - и се придвижете нагоре, докато производителността на четене се увеличава, без да достигате до „Изчакване за заключване на кеша на заявките“ при записи.
„Бъдете внимателни при прекомерно голям размер на кеша на заявките, което увеличава режийните разходи, необходими за поддържане на кеша, вероятно отвъд ползата от активирането му. Размерите в десетки мегабайти обикновено са полезни. Размерите в стотици мегабайти може да не са.“http://dev.mysql.com/doc/refman/ 5.6/en/query-cache.html
