Тъй като избирате данни от две таблици, и двете съдържат поле, наречено id , следователно защо получавате Column 'id' in field list is ambiguous... грешка.
Ако опитате отново същата заявка, но дефинирате кой id искате да изберете с помощта на нотация с точки във формата table.field трябва да работи.
Conversations::find($conv_id)->users()->get(array('users.id','name'))->toArray();
