Вложените заявки за получаване на брой с две условия

Трябва да групирате колона infection и (ip &ipc ) по различен начин, след което ги присъединете, като използвате подзаявка като тази:

SELECT t1.ip, t1.isp, t2.infection, t1.ipc, t1. ispc, t2.incount
FROM
    (SELECT ip, isp, infection, COUNT(ip) as ipc, COUNT(isp) as ispc
    FROM (
       SELECT ip, isp, infection
       FROM tbl1
       UNION ALL
       SELECT ip, isp, infection
       FROM tbl2
       UNION ALL
       SELECT ip, isp, infection
       FROM tbl3
       )x
     GROUP BY ip, isp) t1
JOIN
    (SELECT ip, isp, infection, COUNT(infection) as incount
     FROM (
       SELECT ip, isp, infection
       FROM tbl1
       UNION ALL
       SELECT ip, isp, infection
       FROM tbl2
       UNION ALL
       SELECT ip, isp, infection
       FROM tbl3
       )x
    GROUP BY ip, isp,  infection)t2
ON t1.ip = t2.ip
ORDER BY ip, isp, infection Desc

Вижте този SQLFiddle

Забележка: Мисля, че желаният от вас резултат е грешен, защото:

1. В Table3 няма infection за ip=6 но е във вашия изход
2. infection other липсва във вашия резултат (вместо това има malware )