Заявката за актуализиране не работи с php

Не мисля, че вашият md5-ied user_id преминава в заявка за актуализиране, защото вътре в условието top if няма функция md5(), която изпълнява задачата, и вие също трябва да сте сигурни, че как се съхранява стойността в базата данни, дали е md5- ied user_id или нормален user_id? ако за md5 user_id опитайте така,

if(isset($_GET['user'])){
    $id = $_GET['user'];
    $id = md5($id);
    $sql = "UPDATE request SET email_verification=1 WHERE Id='$id'";
    $result = $conn->query($sql);
    if ($result === TRUE) {
        header('Location: index.php');
    }
    else {
        echo "Error updating record: " . $conn->error;
    }
}