Бих проверил дали имате препратки към външни ключове към тази колона. Ако е така, може да се наложи да премахнете външните връзки, които сте дефинирали за тази колона, след това да преименувате, след което да поставите връзките си с външни ключове обратно на мястото си с новото име на колона.
Мисля, че MySQL се зацикля на факта, че когато преименувате, FK връзките вече не са валидни и хвърля грешка.
РЕДАКТИРАНЕ:ПотвърденоFK Преименуване в MySQL
Ще трябва да направите нещо подобно:
alter table yourTable drop foreign key yourID