Би ли го направило нещо подобно?
UPDATE items
SET position = CASE position
WHEN $oldpos THEN $newpos
ELSE position + SIGN($oldpos-$newpos)
END
WHERE position BETWEEN LEAST( $newpos, $oldpos )
AND GREATEST( $newpos, $oldpos );
Тествах го няколко пъти и изглежда работи.