Codeigniter не може да изтрие редове от таблицата на базата данни, използвайки метода на присъединяване

Използвайте подзаявки.

пример

#Create where clause
$this->db->select('id');
$this->db->from('table2');
$this->db->where('table2.title', $title);
$where_clause = $this->db->get_compiled_select();

#Create main query
$this->db->where('table1.user_id', $user_id); 
$this->db->where("`id` NOT IN ($where_clause)", NULL, FALSE);
$this->db->delete('table1'); 

Препратки

• откраднат от тук:https://stackoverflow.com/a/16303021/1275832
• относно подзаявките:http://www.mysqltutorial.org/mysql-subquery/
• компилиран избор:https://github.com/NTICompass/CodeIgniter-Subqueries