Това звучи като проблем със заключване на база данни. Бих препоръчал да вземете инструмент като innotop и да разгледаме отблизо какво се случва в базата данни. По-специално, бих разгледал внимателно отворените таблици, заключванията и заявките, активни, когато приложението ви grails работи.