Как да разбера колко mysql заявки е направил php скрипт?

По принцип можете да направите функция манипулатор за вашите MySQL заявки, като:

$mysql_queries_count = 0;
$mysql_queries_time = 0;

function _mysql_query($query) {
    global $mysql_queries_count, $mysql_queries_time;

    $start = microtime(true);
    $result = mysql_query($query);
    $mysql_queries_time += microtime(true) - $start;
    $mysql_queries_count++;

    return $result;
}

По този начин ще трябва да замените всички mysql_query( във вашия код с _mysql_query( , което е лесно изпълнимо в повечето текстови редактори.