Мисля, че на въпросите ви бяха почти отговорени в предишния въпрос, който споменахте.
1) Когато създавате таблицата. InnoDB предоставя повече предимства от просто заключване на ниво ред. По-добра скорост, когато имате множество sql клиенти, извършващи актуализации, по-малък риск от загуба/повреда на данни, референтна цялост и т.н... Само с няколко транзакции в секунда (TPS) е малко вероятно да разберете разликата в производителността, но InnoDB е по-надежден и се мащабира по-добре.
2) Само с 2-3 TPS няма да видите никаква значителна разлика между InnoDB и MyISAM. Дори на полудревен хардуер.
FYI, модерно дисково устройство трябва да може да обработва поне ~200 транзакции за актуализиране в секунда.
Препоръчвам ви да прочетете InnoDB , MVCC и ACID .