Ако искате да извикате SQL функция в doctrine2, можете да го направите като Expression Функции но това ще работи само с DQL.
Тук имате пример, който ще ви каже как да използвате функцията DATE_DIFF, която не е включена в доктрината.
$qb = $repository->createQueryBuilder('l');
$qb->expr()->lte(new Doctrine\ORM\Query\Expr\Func('DATE_DIFF',array('lo.start_date', 'CURRENT_DATE()')),'0');