Виждам, че този въпрос е сравнително стар, но за всеки случай:
eCryptfs може да се счита за файлова система, така че трябва просто да го монтирате и след това да насочите своя MySQL datadir
към монтираната директория. Единственият недостатък е, че изглежда не поддържа O_DIRECT, но не мисля, че MySQL го използва, нали?
