Вижте този отговор MySQL пълнотекстово търсене на думи с три или по-малко букви
Не забравяйте да рестартирате и възстановите индексите.
РедактиранеИзпълнете
show variables like 'ft_%';
за да потвърдите, че дължината на думата съответства на това, което сте я задали.